Ботанический сад Цукубы – это не столько туристический объект, а больше серьезное научное учреждение. В его учебных кабинетах, оборудованных самой современной техникой, проводятся уроки для школьников, лекции для студентов, а также занятия для пенсионеров, которые интересуются ботаникой. Большой интерес к растительному миру легко объясняется японскими традициями. Одна из наиболее распространенных в Японии религий – синтоизм – сформировалась из древнего культа одухотворения природы и обожествления умерших предков. Именно поэтому все население Страны Восходящего солнца любуется цветущей сакурой, ухаживает за растениями и украшает ими свое жизненное пространство.
В Ботаническом саду Цукубы есть зона заповедного леса, где нога человека ступает только по асфальтированным дорожкам. В коллекции водных растений каждый вид имеет отдельный водоем, выложенный камнем. В оранжереях с тропическими растениями поддерживается необходимый микроклимат с помощью основательно продуманной системы увлажнения. В саду собраны цветы, деревья и кустарники со всего мира, в том числе и уникальные. Например, микроскопическая вольфия из семейства рясковых. Цветы этого водяного растения признаны самыми миниатюрными в мире – всего 0,3-0,5 мм, и цветет оно крайне редко, ученые считают его чудом природы.